金针菇最佳保存适宜温度为3℃，属于低温生长发育菌，在冰箱里可以保持一部分特性，如果是较成熟的金针菇，建议储存时间最好不要超过三天。

保存金针菇时最好保留较多的菌根，不要切得太短，容易老化腐败，一般可以不需要保鲜袋密封，如果担心食物串味，也可以使用。