甜酒曲用于调料发酵，主要是利用其成分里的根霉具有糖化性能，可以用在调料酱里，将淀粉分解成糖，再通过酒精的发酵作用，最后得到鲜味的酱品。

甜酒曲制作的甜酒酿是米酒曲的最初产品，也是各种酒类制作的基本原料，除了食用外，还可以当作料酒放入火锅，甜酒曲也被广泛应用于调料生产工厂等地。