1、形状上的区别：

金鱼：鱼体可分为头部、躯干、尾部三个部分。头部的最前端是口，后部有鼻、眼和鳃盖。有些品种头部上端有肉瘤，有的品种鳃盖外漏形成翻鳃。金鱼躯干体披鳞片，主要有正常鳞、透明鳞和珍珠鳞。其侧面具有侧线，不同品种金鱼的侧线上鳞、侧线下鳞和侧线鳞数目不尽相同。

鲤鱼：身体侧扁而腹部圆，口呈马蹄形，须2对。背鳍基部较长，背鳍和臀鳍均有一根粗壮带锯齿的硬棘。体侧金黄色，尾鳍下叶橙红色。

2、用途上的区别：

金鱼：金鱼在分类学上与鲫鱼同属一种，与鲫鱼相比，金鱼在外部形态上产生了巨大的变异，因此通常用于观赏。

鲤鱼：鲤鱼经人工培育的品种很多，如红鲤、团鲤、草鲤、锦鲤、火鲤、芙蓉鲤、荷包鲤等，应用于观赏成分比较多，另外也可食用。

3、生活习性的区别：

金鱼：金鱼对水温的适应能力较强，但是不能适应温度的剧烈变化，其适宜的水温在18-26℃，温度过高或过低都会影响金鱼的摄食和生长繁殖。金鱼喜欢偏弱碱性的水，水体的pH值在7.5-8.0较为适宜。

鲤鱼：冬天，鲤进入冬眠状态，沉伏于河底，不吃任何东西。春天产卵，雌鱼常在浅水带的植物或碎石屑上产大量的卵，受精卵在3~4天后孵化。鲤鱼生长很快，大约第三年达到性成熟，在饲养条件下，可以活40年以上。长度平均35公分左右，但最大可超过100公分，重22公斤以上。