1、两者所体现的投资性质和所包含的权利不同

股票投资是一种长期性投资，投资者即为公司的股东，股东与公司之间是一种股东权与公司生产经营权的关系；公司债券投资中的债券持有人是公司的债权人，与公司之间形成的是一种借贷性质的债权债务关系。

股票持有者享有的是综合性的股东权，即有权从公司的利润中获得收益，有权参与公司的经营决策；公司债券持有者享有的是债权，包括到期收取本金和利息的权利、债务人破产时优先分取财产的权利，以及在证券市场转让债券的权利。

2、两者的投资风险程度不同

由于股票投资是没有期限的长期性投资，股东不能要求退股，也获取不了固定的股息和红利，因而股东承担着很大的风险。而公司债券则是风险较小的保守性投资，因为公司债券持有人到期既可以收取固定的利息，又可以收回本金；在收益分配上，尤其是在公司经营亏损或破产时，公司债券持有人都有优先于股东的地位；由公司债券特点所决定，其流通范围和流通频率小于股票，交易价格的变动也较为平稳。