1、水果玉米一般是黄色的籽粒，尤其煮熟之后颜色更加明显，淀粉含量少且为直链淀粉，而糯玉米一般是白色的籽粒，部分品种有彩色籽粒，糯玉米含大量支链淀粉，升糖指数偏高。

2、水果玉米的籽粒手指甲一掐就能破，水分多，食用口感也是又脆又甜，而糯玉米比较不容易掐破，比较硬，但是煮熟食用口感会比较软糯，放久了也会变干，所以也叫粘玉米。

3、水果玉米一般用作煮熟食用和榨汁食用，糯玉米出食用外还可以用作工业生产玉米淀粉。