昆山南站是线正下式车站，站房呈“圆润流畅”的形态，中间高，两侧低，从远处看，它就像一朵盛开的并蒂莲花，体现了江南水乡富有的诗意。

昆山南站的京沪高铁和沪宁高铁开通后，昆山当地的企业、政府与外地之间商务交流活动日益频繁，商务流和观光旅游流成为了昆山南站客流增长的新亮点。