北京站在历史上曾用名前门站、北京站、北平站、北平东站、兴城站等。1949年9月30日改称“北京站”。

北京站，始建于1901年，原址位于正阳门瓮城东侧，建成于1903年，旧时叫“京奉铁路正阳门东车站”。

北京南站始建于1897年，旧时称马家堡站。于2006年5月10日，正式开始封站改造。于2008年8月1日，正式重新启用。