金针菇冷冻之后依然可以吃，只需将其放在室温下解冻即可。但是需要注意冷冻的金针菇解冻后要尽快吃完，以免出现变质的现象。

金针菇比较适合的保存方式是放入冰箱内冷藏，将金针菇表面的水分沥干后，用保鲜膜包裹金针菇并用袋子密封，之后放入冰箱冷藏即可。

金针菇属于低温生长真菌，它的生长环境温度在3～34℃，因此在32℃的环境下，金针菇不仅可以保持较好的活性，还可以抑制其它菌类的活性。