不建议吃野生水芹菜，因为野外的水芹菜受环境影响，存在寄生虫或寄生其它微生物的可能性较大，其食用的安全性很难得到保障。

此外最好不要摘食野外的野生水芹菜，因为野生水芹菜和野芹菜非常像，后者是有毒的，若误食容易导致出现食物中毒的症状。

平时无论是吃水芹菜或野生水芹菜，都最好是煮熟后食用，不建议生吃或榨汁吃，虽然生吃或榨汁营养更高，但同时也会增加感染的风险。