将苦瓜按照质量分开存放，除去有病虫、伤裂、畸形的苦瓜，放进冰箱冷冻室或者冷冻库里进行预冷，等到温度降到5～6°C的时候就可以放进-30°C的速冻冷库进行速冻，将冷库温度设置在-18°，在这种低温环境中，苦瓜最长可以保存7～8个月。

晒干保存

选出质量好的苦瓜，将其清洗干净切成小片，然后平铺在纸上，在天气好光照充足的情况下拿到外面去晾晒，去除其中的水分，晒成苦瓜干，也可以直接用烘烤机烤干，苦瓜晒干后干燥储存保存时间比较久，到第二年也不会变质。

腌制保存

将新鲜无病虫的苦瓜洗净后切成小片，均匀的撒些盐在上面，注意适量不要太咸，把盐和苦瓜搅拌均匀和好，放进干净的密封坛子里就能够保存到第二年，吃的时候直接取就可以了，吃多少拿多少。