生的金针菇含有秋水仙碱，具有一定毒素，对人体有危害，需要加热高温才能破坏，所以最好不要食用生的金针菇，煮熟后再食用。

金针菇买回来后需要扒开冲洗干净，因为里面通常会含有较多杂质及细菌。吃不完的金针菇可以放进冰箱冷藏储存，延长保存时间。