若购买的红毛丹量少，且能较快吃完的话，可以将其在常温的环境中保存。将红毛丹清洗干净，挑出其中的坏果，之后放置在可控干水分的洗菜篮中保存即可，可保存3天左右，最好尽快吃完。

将红毛丹洗净装在可以密封的塑料袋中，浸泡在冰水里也是较佳的保存方法，这个方法能有效防止红毛丹变质，能经得起长时间的运输。这样保存的红毛丹口感会打折扣，一般是运输过程中的保存方法。

日常保存红毛丹最常见的方法是将其放置在冰箱中保存，这样存放的红毛丹保质期较长，一般在10天左右。但是经过冰箱低温冷藏的红毛丹外观颜色会发生改变，出现黑斑等情况，最好快速食用完毕。