1、成分不同：清艾条是由纯艾绒组成，药艾条里则会加入除艾绒之外的其他药物；

2、用法不同：清艾条一般可以做温针灸、回旋灸、雀啄灸，也可以做温灸器灸等。药艾条是用来做实按灸，即将艾条点燃之后隔着几层纱布，随即紧按到病人穴位上；

3、功效不同：清艾条使用后主要是发挥艾灸的一般功效，如通络止痛、温经散寒、温阳益气等。药艾条因为添加不同的药物，其处方不同，因此所发挥的功效也各不相同，如太乙针灸除加艾绒以外还加麝香、乳香、没药、松香、桂枝等，可用于治疗寒湿、头痛、咳嗽等病证。

艾灸是比较适宜作为家庭保健治疗的方法，清艾条和药艾条各有不同，也各有优势，在使用时应在医生指导下根据具体病证选择合适的艾条。艾灸时应注意观察艾灸部位、艾灸温度和操作时间，防止灼伤事故的发生。