1、大小不同，细菌一般比病毒大，直径在0.2-50μm之间，而病毒除个别巨大的病毒以外，一般直径在0.02-0.4μm之间。

2、基本结构不同，细菌属于单细胞的原核生物，具有原核细胞的基本结构，包括拟核、细胞质、细胞膜、细胞壁，特殊结构包括鞭毛、菌毛、荚膜、芽孢。病毒属于非细胞生物，仅有核酸和蛋白衣壳，有些病毒在核衣壳外面有包膜，称为包膜病毒。

3、生长方式不同，细菌具有独立的生长繁殖能力，可以用普通的培养基培养。病毒不具有细胞结构，没有自身生长繁殖、能量代谢、排除废物的能力，必须寄生在活的细胞内才能够生长繁殖，体外不能用培养基培养，必须采用细胞培养。