柠檬茶的营养价值丰富，能起到排毒养颜、延缓衰老、祛痰止咳等多种功效，但不适合空腹或大量的饮用，柠檬茶的酸性比较强，如果空腹饮用会使胃酸增加，给肠胃造成不良的影响，可能会诱发肠胃疾病。

若是大量的饮用柠檬茶，也会给肠胃造成一定的负担，同样会造成肠胃疾病，通常饭后适量的饮用柠檬茶效果最佳，而且还能起到帮助消化的作用，使肠胃更容易消化食物，也可以起到减肥的作用。

柠檬茶也容易腐蚀牙齿，破坏牙齿的细胞组织，造成不同程度的牙齿问题，甚至可能造成牙龈出血等情况，这时需要大量饮用凉白开，稀释柠檬茶中的酸性成份，缓解不良的症状。