细菌属于原核细胞型微生物。微生物分类目前采用的方法是依据其结构的不同进行分类，分为原核细胞型、真核细胞型、非细胞型三类。其中原核细胞型又根据其生物学特性的不同，分为不同的类别：细菌、放线菌、螺旋体、支原体、衣原体、立克次氏体。它们的共性是体积小，分布广；吸收多，转化快；生长旺，繁殖快；适应强，易变异。随着人们对微生物的研究和认识程度的逐渐深入，在不同时期人们对微生物的分类也不一致，目前人们倾向于微生物分类的三域学说。