如果是原核生物，细胞质基质是有DNA的，而真核生物没有。因为原核生物的结构比较简单，没有以核膜包裹的细胞核，所以原核生物的DNA都大多存在于细胞质基质，其RNA也是大多存在于细胞质基质。而真核生物有以核膜为界限的细胞核，核内的染色体由DNA与蛋白质组成，核孔是细胞核与细胞质进行物质交换的通道，因为核孔的大小固定，DNA分子的半径比核孔还有RNA的半径大，所以RNA可以穿过核孔，而DNA只能存在于核内。